最近、FreeBSDのサーバ機で、ports関連のコマンドを実行すると、

Updating the pkgdb in /var/db/pkg … /var/db/pkg/pkgdb.db: unexpected file type or format

のエラーが頻発し、pkgdb -F も pkgdb -uもダメな時がある。

そんな時には、下記のコマンドで、勇気を持って削除

rm /var/db/pkg/pkgdb.db /usr/ports/INDEX*.db

この後に、pkgdb -u でデータベースをリビルド出来る。