こちらの研究所にて、SGI Altixのワークステーションが導入され、MDGRAPE3が近々使用できる予定です。

ＭＤＧＲＡＰＥ-3は（独）理化学研究所高速分子シミュレーション研究チーム（泰地真弘人チームリーダー）が開 発した分子動力学シミュレーション専用の超高速計算機です。ＭＤGRAPE-3チップは、１チップで、165GFlopsの計算速度を実現しています。 MDGRAPE-3を用いることで、たんぱく質や新規材料等の分子動力学シミュレーションの他に、線結晶解析での構造因子計算、渦法やＳＰＨ法による流体 計算、電磁気計算、境界要素法などの計算を加速できます。

ただいま、セットアップ中につき、今しばらく時間がかかりそうです。